Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CSPG4P5Q96PW8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CSPG4P5Q96PW8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CSPG4P5Q96PW8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CSPG4P5Q96PW8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSPG4P5Q96PW8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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