Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NLRP3Q96P20 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms