Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ECHDC3Q96DC8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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ECHDC3Q96DC8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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ECHDC3Q96DC8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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