Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms