Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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HDDC3Q8N4P3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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HDDC3Q8N4P3 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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HDDC3Q8N4P3 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDDC3Q8N4P3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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