Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ELF3-203ENST00000367284 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PTGES3L-201ENST00000409446 1781 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LINC02473-201ENST00000569621 2195 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ANGPTL7-201ENST00000376819 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms