Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms