Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WSCD1Q658N2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms