Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
IMPG1Q17R60 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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