Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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