Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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