Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms