Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms