Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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