Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 COL11A1-203ENST00000370096 7286 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PCDHGB4-202ENST00000615384 4725 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ADAMTS4-202ENST00000367996 9773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AL359075.2-201ENST00000354921 4998 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TMEM8B-201ENST00000377988 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 KCNH1-201ENST00000271751 8172 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 OTOG-201ENST00000342528 4992 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TIAM2-202ENST00000318981 5916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FOSB-210ENST00000591858 3658 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MPP2-221ENST00000625880 4668 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TJP2-201ENST00000348208 4058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PELO-201ENST00000274311 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 KIF26B-201ENST00000366518 12113 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms