Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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