Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRKQ15262 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRKQ15262 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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