Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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