Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GTF2H3Q13889 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GTF2H3Q13889 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GTF2H3Q13889 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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GTF2H3Q13889 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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GTF2H3Q13889 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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GTF2H3Q13889 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GTF2H3Q13889 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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