Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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