Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms