Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms