Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CLN3Q13286 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CLN3Q13286 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CLN3Q13286 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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