Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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