Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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