Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GRIK2Q13002 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms