Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms