Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNH2Q12809 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms