Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms