Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms