Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREMQ03060 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREMQ03060 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREMQ03060 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREMQ03060 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREMQ03060 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREMQ03060 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms