Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPIBQ01892 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms