Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKOR1P84550 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms