Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms