Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SUMO1P63165 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms