Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBASH3AP57075 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBASH3AP57075 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms