Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GSCP56915 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSCP56915 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSCP56915 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms