Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPFP49454 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPFP49454 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPFP49454 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPFP49454 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CENPFP49454 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPFP49454 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPFP49454 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPFP49454 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPFP49454 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPFP49454 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPFP49454 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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