Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NESP48681 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NESP48681 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NESP48681 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms