Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RANGAP1P46060 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RANGAP1P46060 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms