Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AFMP43652 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AFMP43652 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AFMP43652 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms