Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms