Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms