Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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