Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJB2P29033 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJB2P29033 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJB2P29033 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJB2P29033 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJB2P29033 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJB2P29033 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJB2P29033 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJB2P29033 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJB2P29033 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms