Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PSMB4P28070 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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