Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD8P13378 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms