Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DNAL1-201ENST00000311089 2312 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL512274.1-201ENST00000562471 2027 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms