Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

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Length 1,114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RETP07949 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RETP07949 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RETP07949 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RETP07949 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RETP07949 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RETP07949 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RETP07949 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RETP07949 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RETP07949 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RETP07949 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RETP07949 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RETP07949 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RETP07949 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RETP07949 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RETP07949 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RETP07949 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RETP07949 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RETP07949 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETP07949 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RETP07949 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETP07949 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETP07949 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETP07949 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETP07949 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETP07949 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETP07949 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETP07949 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETP07949 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RETP07949 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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