Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGB3P05106 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms